Pirmajā kvalifikācijas kārtā kopā visiem sešiem mazo komandu pilotiem izstājās Bruno Senna, kuram izšķirošo lidojošo apli pēdējā lēnajā līkumā iztraucēja Žans Ēriks Vērnē. Interesanti, ka tieši Verņē uzrādīja 17.rezultātu un neļāva Sennam kvalificēties otrajai kvalifikācijas kārtai. Tostarp ātrāko apļa laiku uzrādīja Romēns Grožāns, kurš izmantoja mīkstās riepas, kamēr vairums vadošie braucēji iztika ar cietā sastāva riepām.
Otrajā kārtā aiz strīpas palika Žans Ēriks Verņē, Daniels Rikjardo, Niko Rosbergs, Pastors Maldonādo, Pols Di Resta, Felipe Masa un arī Mihaels Šūmahers, kuram vēl 10 starta pozīciju sods par sadursmi ar Verņē iepriekšējā posmā Singapūrā. Tomēr Šūmahers, izmantojot cietās riepas pirmajā kvalifikācijas kārtā un lietotas riepas otrajā, ir iekrājis trīs svaigus riepu komplektus, izmantošanai sacīkstē.
Izšķirošajā kvalifikācijas kārtā jau ar pirmo mēģinājumu Sebastians Fetels latiņu pacēla ļoti augstu: 1:30.839s, kas bija par 0,2s ātrāk nekā Markam Vēberam un par iespaidīgām 1,4s ātrāk nekā trešā pozīcijā esošajam Džensonam Batonam. Otro mēģinājumu laikā trasē saslīdēja Kimi Raikonens un dzelteno karogu dēļ vairākiem pilotiem nācās atcelt savus izšķirošos lidojošs apļus. Tomēr tas nemainīja situāciju – ”Red Bull” piloti pirmajā starta rindā, bet Džensons Batons uzrādīja trešo laiku, tomēr būs spiests zaudēt 5 starta pozīcijas dēļ pārnesumu kārbas maiņas. Tāds pats sods arī Niko Hilkenbergam.
Kvalifikācija – Japānas GP
| Rinda 1 | 1. Sebastian Vettel 1'30.839Red Bull | |
| 2. Mark Webber 1'31.09Red Bull | ||
| Rinda 2 | 3. Kamui Kobayashi 1'31.7Sauber | |
| 4. Romain Grosjean 1'31.898Lotus | ||
| Rinda 3 | 5. Sergio Perez 1'32.022Sauber | |
| 6. Fernando Alonso 1'32.114Ferrari | ||
| Rinda 4 | 7. Kimi Raikkonen 1'32.208Lotus | |
| 8. Jenson Button* 1'31.29McLaren | ||
| Rinda 5 | 9. Lewis Hamilton 1'32.327McLaren | |
| 10. Felipe Massa 1'32.293Ferrari | ||
| Rinda 6 | 11. Paul di Resta 1'32.327Force India | |
| 12. Pastor Maldonado 1'32.512Williams | ||
| Rinda 7 | 13. Nico Rosberg 1'32.625Mercedes | |
| 14. Daniel Ricciardo 1'32.954Toro Rosso | ||
| Rinda 8 | 15. Nico Hulkenberg* No timeForce India | |
| 16. Jean-Eric Vergne 1'33.368Toro Rosso | ||
| Rinda 9 | 17. Bruno Senna 1'33.405Williams | |
| 18. Heikki Kovalainen 1'34.657Caterham | ||
| Rinda 10 | 19. Timo Glock 1'35.213Marussia | |
| 20. Pedro de la Rosa 1'35.385HRT | ||
| Rinda 11 | 21. Charles Pic 1'35.429Marussia | |
| 22. Vitaly Petrov 1'35.432Caterham | ||
| Rinda 12 | 23. Michael Schumacher** 1'32.469Mercedes | |
| 24. Narain Karthikeyan 1'36.734HRT |